Во время Свирско-Петрозаводской операции решением Военного Совета Карельского фронта в Лодейном Поле создается мемориал славы - военно-музейный комплекс "Свирская Победа", являвшийся филиалом Центрального музея Вооруженных Сил. Был разбит парк площадью 19 га. На его территории были построены: памятник-приказ со скульптурой И.В.Сталина (высотой 5,5 м); павильоны: авиации, артиллерии, войск связи, бронетанковых и инженерных войск; главное здание музея. Музей насчитывал десятки тысяч подлинных экспонатов, большей частью своей уникальных, таких, например, как самолет Героя Советского Союза летчика Л.А.Гальченко. Однако сталинское время не пощадило этот выдающийся памятник эпохи борьбы с фашизмом.
В 1951 году по приказу И.В.Сталина мемориал "Свирская Победа" был уничтожен одновременно с музеем обороны Ленинграда, созданным во время блокады. Это произошло в связи с так называемым "ленинградским делом", целью которого было стереть из памяти советских людей подвиг отцов и дедов во время блокады Ленинграда.
В уцелевшем главном здании военного музея "Свирская Победа" с 1968 года размещен историко-краеведческий музей. В 1975 году он вошел в состав Объединения музеев Ленинградской области, а в 1998 году это Объединение было реорганизовано в ЛО ГУК "Музейное агентство". На сегодняшний день Лодейнопольский историко-краеведческий музей является филиалом "Музейного агентства".
С 1989 по 2007 неоднократно обновлялись экспозиции музея. При поддержке Европейского Союза в марте 2004 года открыта новая экспозиция, посвященная теме природы и Нижне-Свирскому заповеднику. В апреле 2005 года была открыта экспозиция "Здесь при Петре трудами наших дедов для Балтики рубились корабли…" на деньги Президентского гранта. Экспозиции музея никого не оставляют равнодушными, оно охватывают различные периоды истории: от древности до наших дней.
"Уездный город" рассказывает о быте и традициях уездного города конца 19 - начала 20 вв.;
"Купцы лесопромышленники Якимовские" - о Почетном гражданине города учителе А.А. Якимовском;
"Крестьянский быт" - о традиционных промыслах, традициях, жизни коренного населения многонационального уездного городка;
"Становление Советской власти в Лодейнопольском уезде" - история Гражданской войны в Лодейнопольском уезде, становление советской власти, стройка первых пятилеток Нижнее - Свирская ГЭС.;
"Свирско-Петрозаводской операция" - о событиях Великой Отечественной войны.
Фонд музея насчитывают около 17 тысяч экспонатов. Она славится своей этнографической и художественной коллекциями, в ней имеются материалы, посвященные памяти великого русского художника В.Д. Поленова, гордостью музея являются работы художника С.Н. Зенкова, окончившего Академию Художеств с золотой медалью. Уникальна коллекция картин, созданных военными художниками Карельского фронта. Особый интерес представляет коллекция знаменитой оятской керамики. Одной из богатых в объединении музеев Ленинградской области является нумизматическая коллекция.